Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF827Q17R98 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF827Q17R98 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms