Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DDR2Q16832 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDR2Q16832 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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