Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms