Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NTRK2Q16620 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms