Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC18A3Q16572 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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