Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP2Q16527 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP2Q16527 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms