Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SSX1Q16384 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SSX1Q16384 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SSX1Q16384 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SSX1Q16384 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SSX1Q16384 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SSX1Q16384 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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