Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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