Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEDD8Q15843 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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