Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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