Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED1Q15648 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED1Q15648 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED1Q15648 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MED1Q15648 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED1Q15648 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED1Q15648 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED1Q15648 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED1Q15648 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED1Q15648 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED1Q15648 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED1Q15648 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED1Q15648 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED1Q15648 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED1Q15648 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED1Q15648 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED1Q15648 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED1Q15648 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED1Q15648 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED1Q15648 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MED1Q15648 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MED1Q15648 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MED1Q15648 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED1Q15648 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED1Q15648 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms