Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIP13Q15645 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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