Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCOLCEQ15113 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms