Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPRCAPQ14761 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms