Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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