Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTTNQ14247 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms