Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPSQ13938 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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CAPSQ13938 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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CAPSQ13938 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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CAPSQ13938 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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CAPSQ13938 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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CAPSQ13938 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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CAPSQ13938 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPSQ13938 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
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