Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PKP1Q13835 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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