Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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