Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IKZF1Q13422 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms