Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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AP3B2Q13367 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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AP3B2Q13367 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3B2Q13367 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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