Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCGQ13326 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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