Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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