Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K1Q13233 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms