Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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RPA4Q13156 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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