Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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