Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms