Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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LMAN2Q12907 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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LMAN2Q12907 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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