Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms