Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms