Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP4Q09028 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms