Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD47Q08722 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD47Q08722 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms