Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SOX4Q06945 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms