Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPN11Q06124 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms