Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms