Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms