Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms