Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms