Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MYBPC1Q00872 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYBPC1Q00872 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms