Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms