Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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FAM3AP98173 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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FAM3AP98173 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FAM3AP98173 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FAM3AP98173 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FAM3AP98173 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM3AP98173 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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