Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKP1P63208 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP1P63208 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP1P63208 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP1P63208 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms