Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VBP1P61758 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VBP1P61758 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms