Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EEFSECP57772 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms