Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BACE1P56817 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BACE1P56817 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BACE1P56817 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BACE1P56817 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BACE1P56817 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BACE1P56817 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BACE1P56817 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BACE1P56817 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BACE1P56817 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BACE1P56817 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BACE1P56817 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BACE1P56817 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BACE1P56817 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BACE1P56817 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BACE1P56817 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BACE1P56817 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BACE1P56817 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BACE1P56817 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms