Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKAA2P54646 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms