Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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KCNQ1P51787 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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KCNQ1P51787 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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KCNQ1P51787 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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KCNQ1P51787 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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KCNQ1P51787 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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KCNQ1P51787 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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KCNQ1P51787 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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KCNQ1P51787 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNQ1P51787 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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