Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPAP49450 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPAP49450 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPAP49450 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPAP49450 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPAP49450 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPAP49450 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPAP49450 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPAP49450 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPAP49450 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPAP49450 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CENPAP49450 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CENPAP49450 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPAP49450 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms