Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms