Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCAMP43121 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCAMP43121 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MCAMP43121 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCAMP43121 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCAMP43121 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCAMP43121 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCAMP43121 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms